Les mécanismes de mélange de l'eau douce et de l'eau océanique contribuent à la variabilité des conditions physiques, chimiques et biologiques d'un estuaire. Les organismes qui vivent dans ces écosystèmes sont adaptés à ces conditions environnementales spécifiques, formant des communautés considérées comme parmi les plus productives de la biosphère. Le présent travail avait pour objectif de caractériser la structure et la composition de la communauté phytoplanctonique dans l'écosystème estuarien du fleuve Maraú - Baie de Camamu (BA) et ses relations avec les paramètres environnementaux.