Zehn Jahre nach dem Angriff der Killertomaten sind die Überlebenden immer noch traumatisiert von den schrecklichen Ereignissen. Schon der Anblick einer Tomate löst Panik aus. Doch der verrückte Professor Mortimer Gangreen hat furchtbare Pläne. In verbotenen Experimenten ist es ihm gelungen, Tomaten in Menschen mutieren zu lassen und so erschafft er sich seine eigene todbringende Killertomaten-Armee.
Als der Pizzeria-Angestellte Chad herausfindet, dass ausgerechnet seine Traumfrau, die wunderschöne Tara, auch eine von Gangreens Mutationen ist, trommelt er eine Handvoll Kumpels zusammen und nimmt den Kampf mit dem Professor auf.