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MikroRNA-Zielprotein Identifizierung mittels quantitativer Proteomik (Lößner, Christopher)
MikroRNA-Zielprotein Identifizierung mittels quantitativer Proteomik
Untertitel Etablierung und Validierung quantitativer Proteomik-Techniken zur Identifizierung von mikroRNA-Zielproteinen im Mantelzelllymphom
Autor Lößner, Christopher
Verlag Südwestdeutscher Verlag für Hochschulschriften
Sprache Deutsch
Einband Kartonierter Einband (Kt)
Erscheinungsjahr 2010
Seiten 212 S.
Artikelnummer 36368158
ISBN 978-3-8381-1937-3
CHF 115.00
Zusammenfassung

MikroRNAs (miRNAs, miRs) sind endogene etwa 22 Nukleotide lange RNAs. Sie binden an Bereiche innerhalb der messenger RNAs (mRNAs) und regulieren dadurch ihre Ziele post-transkriptional. Ihre Wirkung ist dabei nur zu einem geringen Anteil die mRNA Degradation, der Hauptmechanismus besteht in der Inhibition der Translation. In dieser Arbeit sollten miRNA Ziele auf Proteinebene identifiziert werden. Um dies zu ermöglichen, wurden zwei verschiedene quantitative Proteomik-Techniken eingesetzt. Bei der 2D DIGE (zweidimensionale difference in-gel electrophoresis) handelt es sich um eine Gel-basierte und bei SILAC (stable isotope labelling by amino acids in cell culture) um eine Gel-freie, massenspektrometrische Quantifizierungstechnik. Aufgrund der höheren Proteomabdeckung und damit auch der höheren Anzahl durch miR-155 regulierten Proteine stellte sich die SILAC-Technik als die geeignetere Methode heraus. Des Weiteren konnte erstmalig auf Proteomebene gezeigt werden, dass mikroRNA Zielproteine Zelllinien-spezifisch sind. Aufgrund dieser Erkenntnisse wurden die für die Mantelzelllymphom Krebsentität relevanten Zielproteine von miR-15a und miR-16-1 in der Granta-519 Zelllinie untersucht.

Christopher Lößner, geboren 1980, schloss 2006 sein Studium derBiologie mit der Diplomarbeit am Max-Planck-Institut fürBiophysik ab. Die diesem Buch zugrundeliegende Dissertationfertigte er innerhalb von drei Jahren am DeutschenKrebsforschungszentrum an. Seit Anfang 2010 forscht er amInstitute of Molecular and Cell Biology in Singapur.